在《精灵宝可梦Go》中有许多被称之为 PokéStop 的据点，玩家可至这些据点领取奖励品跟道具，以及捕捉神奇宝贝。这样的设计让许多玩家因此到处走透透，提高了不少地区的活跃度，整体来说是个好现象，但并不是所有人都这麽觉得。某些区域出现神奇宝贝已引起争议。

上面的图片，是一位玩家宣称在华盛顿的美国大屠杀纪念博物馆裡所拍摄的，在纪念犹太人大屠杀事件的纳粹毒气室发现了神奇宝贝「瓦斯弹」。该张图片引发了不小的争议，毕竟这是一个相当严肃且哀伤的纪念地点，成了玩家前来玩乐抓神奇宝贝的据点，被认为是一件不尊重博物馆和受害者的作法。

该张图片在出现没多久后已遭删除，是否是真的也引起了不少讨论，但这类的尊重问题并不是只有美国大屠杀纪念博物馆才有，近期美国阿灵顿国家公墓（军人公墓）也出现了这类的议题。《精灵宝可梦Go》在美国上架后，不少玩家也涌入了公墓捕捉神奇宝贝，还以墓碑为背景拍下捕捉神奇宝贝的瞬间，引起了不少争议，也让公墓管理处发出公告，要玩家们给予死者该有的尊严，禁止在公墓玩《精灵宝可梦Go》。

任天堂在先前便已表示世界各地的知名景点、热门区域或是历史纪念地点都会成为《精灵宝可梦Go》的 PokéStop，但并未提到未来是否会因应状况撤销某些据点的计画，当下要解决这些类似的事件，恐怕只能依靠玩家自制来防范。

但《精灵宝可梦Go》所面临的问题也不只据点的问题，在澳洲也开始出现居民因不满玩家聚集在自家住处附近，而朝玩家砸鸡蛋和水球甚至还报警引发衝突的事件。《精灵宝可梦Go》的诞生确实带动了玩家走出住家四处走动，但也相对地带来了不少问题，要解决这些状况，恐怕除了玩家自制之外，官方或许也得开始著手拿掉某些道馆和 PokéStop 来避开这些衝突了。