模式介绍：

挑战模式是《高达VS》新加入的单人模式，共有10条路线供玩家选择。此模式整体结构与之前的街机模式较为相似，但挑战模式中每条路线均为单独存在，不像之前一样以网格式互通。挑战模式不支持多人联机，玩家只能与每关固定的CPU组队进行攻略。

每条路线都有包含分支路线的关卡，将一条分支中的全部关卡通过后就算路线通关。关卡共有3种类型：小队战、目标战、BOSS战。小队战即游戏中最标准的对战形式，将敌方的总体力值耗尽即可过关，在挑战模式后期关卡中，敌方的体力值会数倍于我方;目标战是击坠特定目标的特殊战斗，玩家需要击破场上的敌机直至目标出现，之后击坠目标过关;BOSS战是一种特殊的目标战，在此关卡下玩家将面对实力远胜于普通敌机的巨型MA，将其击坠后过关。

每关结束后会根据玩家的表现给予评分，整条路线通关后会根据整体表现给予评价，若评价达到“S”以上则会开启隐藏关卡。路线评价最高为“SSS”，想要获得相关奖杯就需要全10条路线获得“SSS”评价。

挑战模式共有10条路线，其中路线1至7的难度都不算高，基本都可以碾压过关，但从路线8开始会出现强力敌人配置的关卡，在这些关卡中玩家将面对强力MA、复数500机、常时觉醒机体等等，敌人的总战力会升至玩家队伍的一倍以上，游戏难度陡增。