导读：三周目当中亦有两条分支线，分别是A2线和9S线，其实两者都会汇聚在一起，而它们各自有少量不同的主线任务，因此本文第三周目的攻略也会分为A2线和9S。

请留意小标题名称，区分9S的二周目和三周目内容。

A2线-序幕：拜托了，A2！

第一节：基地

step1.一上来先控制2B去到YoRHa机库取得机甲参与大规模扫荡行动。

9S独白：最后一场大规模进攻作战就开始了。但是我还不知道这场战争的结果，以及我们的命运。

step2.接着会控制9S进行瘫痪敌方防空系统的工作。

一共有5个地点，这些只需要骇入目的地中的机械人即可。

要注意在高架桥上的机械人属于自杀式炸弹，无法避免其自爆。

最后一个机械人是在通信塔设施前，需要先骇入一个小机器人靠近目标，然后进行间接骇入。

step3.接着战况恶化，需要9S与2B汇合。此时如果9S还控制着小机械人的话，按住B键进行自爆，然后就可以让9S火速回到通往工厂的大桥上。

step4.随后切换为2B，这时候2B要进行空战，接着就可以在桥面上与9S汇合。

接着前往多个地点支援其他突击部队，每场战斗结束后都会有YoRHa战士加入到2B的小队当中。

step5.当攻向最后一个地点时，一群受感染机械人靠近2B的小队导致他们部分人出现异常情况。

游戏会切换为9S，落到地面先击退在场的小机械人。

紧接着找到2B，骇入她令她暂时恢复正常。不过其他YoRHa战士已经完全失常并且攻击2B和9S他们，将他们击倒即可。

step6.9S搜索出释放干扰YoRHa信号的凶徒，那就是在深坑中的巨臂机械人。

虽然击倒敌人，但YoRHa受感染的士兵数量非常非常庞大，一下子就包围了9S和2B，两人最终只好选择用自毁来解决问题。

step7.当2B从YoRHa基地中苏醒以后，走出房间就可以与9S汇合。

两人前往司令部，虽然一开始遭到指挥官的怀疑，但后来发现在场所有YoRHa战士、通信员全都受到感染。

指挥官在2B、9S的护送下去到走廊上，可是现在问题是连防火闸门都被敌人入侵，清理走廊内的所有敌人，在通往机库的闸门前逗留一会儿就可以打开。

剧情：指挥官意识到自己也被感染，决意守着机库的大门好让2B和9S离开，他们两人是YoRHa最后的队员，指挥官给他们两人下达最后的命令是要活下去。

2B和9S驾驶机甲飞抵地球，期间在屋顶上再次遇见一台机械人为了救同伴的场景（二周目开头弟弟救哥哥的片段）。