根据搜集到的各种资料，这3年特遣舰队的状况可以分成3个阶段：到来，爆发，灭亡。

1、到来。这是在2311年8月29日之前的事，此时舰队刚刚抵达T—沃兰提斯行星，人员状况良好。舰队有四艘主要舰艇：旗舰诺亚诺克号，补给舰新星号，科研船格利列号和战舰布鲁西洛夫号。虽然这艘船的合作任务无法完成，但在第4章找到的SCAF文物上有新星号舰长向诺亚诺克号舰长的吐糟，说舰队里有一艘带着几十万地雷的战舰出现很奇怪。而拉姆利的记录里也有把富兰克林号上的“幸存者”带到格利列号去研究的说法，于是这艘战舰多半就是布鲁西洛夫号了。

虽然塞拉诺后来的记录提到舰队刚到达目的地就受到了影响，但此时“卫星”受制于“远古机器”，似乎一时也不想对先遣队做什么负面的事，或许更想让他们找到“远古机器”来解放自己。于是挖掘队员的记录里只是顶多提到了要TURN IT OFF，大家都不由自主地干劲十足想找到什么。所以拉姆利的记录直到2311年10月11日之前都没什么特别的事情，大家只是表面上按部就班地做着“自己在做”的事。此时唯一的一条奇怪记录就是克罗吉亚号飞行员在发现信标后出现头痛的症状。（第五章的SCAF文物记录）

2、爆发。如果说在2311年10月11日前人们受到的仅仅是心理暗示的话，这一天发生的多半是件大事。虽然从挖掘组的记录中可以看到很多怪事，但这些都可以被人为掩盖。连拉姆利这样的非科研人员都知道的事多半是大事。那时可能发生的事200年后艾克萨一行人在重做SCAF的实验时也遇到过——大蜈蚣被弄醒了。

不过这应该还没完，塞拉诺的记录里提到他们发现了一只还活着的罗塞塔。这对“卫星”来说可是个大威胁，因为从研究员们的记录来看他们的发现已经渐渐地连贯了起来，如果让他们知道了“远古机器”的真正用途那就不妙了。于是深层挖掘队很可能在此时受到了恶意的攻击，不只是精神上的（很多幸存的人都变成了后来的再生怪），从记录上看他们还被那些远古的罗塞塔尸变体攻击。

而舰队的末日也差不多是从这个时候开始的吧，船员记录提到地面基地不断把尸体运到船上。司令官格拉弗斯明显对这种事情准备不足，让船员们把尸体草草放到货仓里了事。新星号上多半也接收了深层挖掘组的尸体，因为艾克萨只在这条船和地下遗迹遇到过再生怪。

差不多在这个时间段地面基地也出现感染事件，富兰克林号的驾驶员记录（第六章SCAF文物记录）也显示整个机组的人都不对劲，紧接着拉姆利的记录在13日就提到这艘船坠毁了。然后15日补给站就发现了那些本该死掉的机组人员，虽然把“他们”抓到格利列号上去研究了，但紧接着的16日补给站就出了问题——拉姆利这条宝贵的线索就这么在疯癫的文字下断掉了。到24日，拉姆利已经成了一个食人狂。也不知道过了多久，虽然疯狂的补给站人员毁掉了食物，不少士兵也开始吃死尸和尸变体的肉，塞拉诺一行人的记录却显示他们又有进一步的进展。但此时的局面却相当棘手，第9章一个普通列兵的记录显示他们一直在和包围自己据点的前战友没完没了的作战。

一句话，SCAF在补给不足的情况下打一场必败的消耗战，灭日的到来只是时间问题。

3、灭亡。在地面基地苦撑的同时舰队也好不到什么地方去，司令官格拉弗斯也发疯了，马哈德少将接替了她的位置。在他和塞拉诺的语音记录里可以发现两人相处并不融洽，这也为后来的结局埋下了伏笔。一直抵抗着精神攻击的塞拉诺此时似乎也感到了失去司令官这个靠山后的不利处境和失败的阴影，暗地里到处留下语音记录为后来者指路。

此时塞拉诺最重要的记录就是发现了那个活着的罗塞塔是操作“远古机器”的钥匙，并破解了它们的语言，发现它们为了消**印的威胁而选择自我牺牲以达到同归于尽的目的。他决定继续走那些外星人的老路启动“远古机器”牺牲自己拯救人类（19章外星人文物）。

而几乎同时马哈德少将也发现事态失控，于是实行了自己的拯救人类方式——执行5号预案，毁灭所有知道神印计划的人和全部资料。在格利列支线中塞拉诺的同事得知军方的计划后用生命的代价通知了他，他只好把罗塞塔做成切片标本分散藏了起来。

两个无私的人都行动了起来，塞拉诺教授孤注一掷地来到地下遗迹，却发现负责运输密匙的运输机在尸变体的攻击下失事了（序章SCAF文物）。万般无奈之下他联系到了幸存的提姆和山姆，两人英勇地夺回了密匙但却撞见了马哈德少将。少将在完成T—沃兰提斯的5号预案后删除了密匙中的信息，塞拉诺在“远古机器”附近怀着两人一定会来的希望郁郁而终。

T—沃兰提斯行星上所有人都死了，一切都回归平静。SCAF特遣舰队也退出了历史舞台。